O primeiro passo para a resolução dos problemas ambientais gerados pela má gestão dos recursos hídricos é o desenvolvimento de metodologias de diagnóstico eficientes. A avaliação do estado global das águas superficiais resulta da avaliação do estado ecológico que tem em consideração diversos elementos de qualidade (elementos biológicos, elementos físico-químicos, poluentes específicos e elementos hidromorfológicos de suporte aos elementos biológicos) em articulação com o estado químico (analisa substâncias químicas consideradas prioritárias e outras consideradas perigosas de acordo com as Normas definidas a nível europeu), sendo que a classificação final resulta da pior classificação para cada elemento de qualidade. O projeto guarda-rios centra-se na monitorização, em tempo real, de alguns parâmetros físico-químicos, no entanto, de forma a realizar uma abordagem mais integrada serão também analisados parâmetros biológicos, na proximidade dos locais onde forem instaladas as estações de monitorização, permitindo também uma articulação de resultadas, da qual resultará uma maior fiabilidade.